Від початку повномасштабного вторгнення пішов добровольцем до лав захисників нашої Батьківщини. Під час захисту села Кам'янське Запорізької області отримав мінно-вибухову травму, але одразу після відновлення повернувся на бойові позиції.
05.02.2023 року, знаходячись на бойовій позиціїу селі времівці Волноваського району Донецької області, Володимир Миколайович загинув разом із чотирма захисниками України. Ворог підірвав позицію, що спровокувало детонацію бойових комплектів.
14 місяців Володимир Гапонюк вважався зниклим безвісти. На жаль, реультат ДНК-експертизи дав збіг з ДНК рідними солдата.
10.04.2024 родина попрощалась з Володимиром Гапонюком.